Aplicação de SMILES strings na identificação de grupos funcionais responsáveis pela atividade biológica em compostos medicinais

Autores

  • Sholeh Maslehat Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
  • Soroush Sardari Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
  • Mehdi Soheilizad Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
  • Payman Nickchi Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran

Palavras-chave:

Atividade Biológica, Grupo Funcional, Medicina, SMILES

Resumo

Uma abordagem eficiente e prática para a identificação de grupos funcionais importantes na estrutura de moléculas medicinais que são o principal fator para criar atividade biológica pelo uso do sistema de notação de linha SMILES é descrita. Simplicidade, alta proficiência e rapidez no timing são os principais métodos atuais. Neste estudo, pretendemos encontrar uma associação entre alguns dos grupos funcionais identificados, usando o código SMILES e suas propriedades biológicas correspondentes no banco de dados do Canadá. Neste estudo, cada grupo funcional e sua categoria que foi testada é apresentada no número correspondente de ocorrências na categoria e o número total também é mostrado. O valor de p para cada grupo funcional - categoria é calculado usando o teste de proporção e o software estatístico R. Os resultados tabulares, a última coluna indica o impacto da nossa hipótese, por exemplo, grupos funcionais sulfoniluréia e 5-tio-1H-tetrazol estão associados à sua categoria correspondente e são significativos ao nível 0,05. A penicilina e o 3-aminopropano-1,2-diol também são significativos na maioria de suas categorias. Desenvolvemos um método para criar uma relação lógica e robusta entre grupos funcionais e atividade biológica de moléculas. De acordo com o protocolo existente, é possível encontrar grupos funcionais responsáveis pela atividade biológica de compostos medicinais ou químicos.

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Biografia do Autor

Sholeh Maslehat, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran

Drug Design and Bioinformatics Unit, Department of Medical Biotechnology, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, #69 Pasteur Ave., Tehran, 13164, Iran

Soroush Sardari, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran

Drug Design and Bioinformatics Unit, Department of Medical Biotechnology, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, #69 Pasteur Ave., Tehran, 13164, Ira

Mehdi Soheilizad, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran

Drug Design and Bioinformatics Unit, Department of Medical Biotechnology, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, #69 Pasteur Ave., Tehran, 13164, Iran

Payman Nickchi, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran

Drug Design and Bioinformatics Unit, Department of Medical Biotechnology, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, #69 Pasteur Ave., Tehran, 13164, Iran

Referências

Favre, H, Powell, W. (2013). Nomenclature of organic chemistry: IUPAC recommendations and preferred names 2013: Royal Society of Chemistry.

Law, V., Knox, C., Djoumbou, Y., Jewison, T., Guo, A., Liu, Y., Maciejewski, A., Arndt, D., Wilson, M., Neveu, V., Tang, A., Gabriel, G. y Adamjee, C, Dame, Z., Han, B., Zhou, y Wishart, D. (2013. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic acids research 2013;42(D1):D1091-D7.

Lawal, B. (2014). Applied statistical methods in agriculture, health and life Sciences: Springer.

Lehmann, E., Romano, J. (2005). Testing Statistical Hypotheses (Springer Texts in Statistics). Lemke, T. (2003). Review of organic functional groups: introduction to medicinal organic chemistry: Lippincott Williams & Wilkins.

Team RC. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. 2013. ISBN 3-900051-07-0; 2014.

Weininger D. SMILES (1988). A chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules. Journal of chemical information and computer sciences; 28(1): 31-6.

Wishar, D., Knox, C., Guo, A., Shrivastava, S., Hassanali, M., Stothard, P., Chang, Z., Woolsey, J. (2006). DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration. Nucleic Acids Research; 34(suppl_1): D668-D72.

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Publicado

2018-02-27

Como Citar

Maslehat, S., Sardari, S., Soheilizad, M., & Nickchi, P. (2018). Aplicação de SMILES strings na identificação de grupos funcionais responsáveis pela atividade biológica em compostos medicinais. Amazonia Investiga, 7(12), 245–254. Recuperado de https://amazoniainvestiga.info/index.php/amazonia/article/view/596

Edição

Seção

Articles